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牢房作為初始關卡，基本上難度不大（零細胞）。被廣大細胞玩家稱為快樂老家。
首先，我們介紹一下牢房：
基礎房間
這些房間會為你提供戰鬥的必需品
1-1：初始房間
這是開始遊戲時玩家所生成的房間，會包括：斬首臺(紅圈處)：互動劇情
S人的錢袋(紫圈處)：在收藏家處研究獲得，如果上一局死亡，會保留金幣。保留的金幣數有最大限制，在收藏家處升級後可以提高上限
兩個隱藏圖紙：“迅捷之弓”圖紙與“脫離戰線”圖紙
1-2：研究室
此房間可以切換細胞數(切換難度)以及檢視你已獲得的圖紙以及它們的研究進度。目前遊戲最高五細胞
圖一：圖紙展覽
圖二：細胞切換管(圖中展示一細胞)
1-3：更衣室
此房間由研究室右下角的門(圖一)進入，在解鎖任意服裝後開啟
可以在其中切換服裝(圖二)
1-4：管道房\/裝備房
在裝備房中，你可以獲得生鏽的刀，弓和老木盾，在解鎖隨機刀弓盾之後便會從你已解鎖的武器中挑選
擊敗一細胞國王之手後，會掉落圖紙“回收管道”，投資150細胞解鎖後即可升級為管道房(圖)，武器房中會刷出四個管道，每個管道中包括一把劍，一把弓，一面盾以及兩個技能。你可以挑選其中一個管道的裝備，但選擇一個後其他的便會消失。解鎖回收管道後，原本存放初始武器的地方會改為刷出一個隨機護符
PS：回收管道只有在研究隨機刀弓盾後才可使用到完全體!
1—5：記錄者和魔鏡
記錄者可以理解為查戰績，裡面記錄了你的進度。魔鏡主要作用是顯示當前難度下哪種怪物有圖紙。
2：特殊地形
2-1：機關門
牢房中必定會包含一個位於通往有罪者大道必經之路的機關門(如圖)。此門無法被打破，會在門上方生成一個擁有3～4層平臺的獨立長方形房間(例如圖中的平臺就是入口)，房間有怪物並且與其他房間互不相連，最頂層處有一個開關，按下後即可開啟機關門
2-2：藤蔓
通往猛毒下水道的必經之路，只有在獲得藤蔓符文後才可使用並進入。其他地圖也有。
2—3：花房
需安裝DLC“壞種”
由傳送符文抵達，第一次進入時會重新整理“王室園藝師屍體”，調查後可獲得服裝圖紙“王室園藝師”並掉落“荒廢植物園鑰匙”，再向前走會抵達一個長方形房間，房間內有三朵食人花，由下往上依次排列，玩家在跳上食人花後，食人花將劇烈顫動，之後閉合對玩家造成傷害。在閉合階段跳上食人花會被彈起。在由食人花登上房間頂部後，即可使用鑰匙開啟機關門並進入地圖“荒廢植物園”。第一次進入後之後即可直接用傳送符文進入
2—4：大門
需要DLC巨人的崛起（遊戲自帶）
在擊敗王手後回到牢房會發現牢房裡的骷髏消失了。大門也被破開。進去後可以獲得山洞鑰匙。在墓地使用後可以進入山洞。
2—5：傳送門
用於玩家遠距離趕路。（其他地圖也有）
2—6：威力卷軸
可以選擇三個分支：暴虐，戰術，生存。會提高相應的武器和技能的數值。以及生命值。（其他地圖也有）
3：怪物
牢房怪物相比其他來說比較簡單，主要有：殭屍，弓箭手，炸彈兵，盾牌兵（個人叫法）
殭屍有兩種攻擊方法，第一種是近戰下劈，第二種是向前跳躍。兩種攻擊前搖較大，可以招架或翻滾躲避。
弓箭手就是射箭，可以招架或翻滾。招架會反彈箭矢。當你離它較近時，會後撤步。
炸彈兵攻擊方式為丟炸彈，建議優先解決。炸彈會延遲爆炸。可以移動躲開爆炸範圍或招架反彈。
盾兵算是一個有點強的怪，正面無敵，攻擊方式是衝撞，有前搖，可以翻滾躲避或招架。建議背後偷襲或用冰凍。